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长沙市妇幼保健院(长沙市妇幼保健计划生育服务中心):遗传学罕见病综合防控民生项目外送标本检测服务采购需求公开

湖南 长沙市
企业采购
招标预告
发布时间:2023-12-23
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2023-12-23
预告 | 长沙市妇幼保健院(长沙市妇幼保健计划生育服务中心):遗传学罕见病综合防控民生项目外送标本检测服务采购需求公开
招标详情

*、功能及要求:

1.检测内容:**对染色体非整倍体、****以上的缺失重复、宫内目标病原感染检测。

2.检测方法:高通量测序技术。


*、相关标准

检测范围:*次性检测人类基因组中2*多个基因上约***个外显子突变及外显子相邻****的内含子区中的点突变(检测准确率为**%以上)、小的缺失插入突变(****以内)(检测准确率为**%以上),以及外显子水平的缺失重复变异(包括****基因7号外显子的缺失情况)(检测准确率为**%以上)。解读****数据库中致病机理明确的5,***多种疾病。

个性化分析以下**种疾病和**个相关基因,对以下疾病和基因的致病和疑似致病位点的携带情况进行检测,其中地中海贫血的检测范围需涵盖α地贫缺失型、α地贫非缺失型、β地贫缺失型和β地贫非缺失型。(须提供既往检测报告复印件证明材料)


*、技术规格

主要技术参数及系统概述:

2.1. ***-***检测项目

1.检测内容:**对染色体非整倍体、****以上的缺失重复、宫内目标病原感染检测。

2.检测方法:高通量测序技术。

3.样本类型:流产组织、绒毛、羊水、脐带血、外周血等。

4.报告周期:收到样本7工作日内。

5.数据量:平均有效数据量≥***;单样本检测有效数据量要求≥*** *****。

6.检测设备获得****认证,且可用于对来源于人体样本的脱氧核糖核苷酸(***)和核糖核酸(***)进行测序,以检测基因变化。

7.检测错误率低。采用***纳米球的线性扩增,始终以原始序列为模板进行扩增,避免错误积累,检测错误率低。

8.自样品放入基因测序仪后无需***反应,减低***反应带来的错误。

9.使用自主研发的国产化测序平台,且检测设备被列入科技部创新医疗器械产品目录的,优先考虑。

**.具备染色体非整倍体分析相关软件注册证,可用于**、**、**、**、**、X和Y染色体非整倍体的辅助性判断(提供注册证)。

**.具备染色体非整倍体检测试剂盒医疗器械注册证。

**.投标人具有***-***智能化解读云平台,提供智能化****打分、变异注释、自动出报告等***解读本地化方案。

2.2.、临床全外显子组检测

1.检测范围:*次性检测人类基因组中2*多个基因上约***个外显子突变及外显子相邻****的内含子区中的点突变(检测准确率为**%以上)、小的缺失插入突变(****以内)(检测准确率为**%以上),以及外显子水平的缺失重复变异(包括****基因7号外显子的缺失情况)(检测准确率为**%以上)。解读****数据库中致病机理明确的5,***多种疾病。

2.个性化分析以下**种疾病和**个相关基因,对以下疾病和基因的致病和疑似致病位点的携带情况进行检测,其中地中海贫血的检测范围需涵盖α地贫缺失型、α地贫非缺失型、β地贫缺失型和β地贫非缺失型。(须提供既往检测报告复印件证明材料)

序号

疾病名称

检测基因名

序号

疾病名称

检测基因名

1

地中海贫血(α/β)

***/***

6

常染色体隐性耳聋**型/4型

****/*******

2

进行性假肥大性肌营养不良

***

7

眼皮肤白化病1型/2型

****/****

3

成人型多囊肾1型/2型

****/2

8

肝豆状核变性

*****

4

甲型血友病

**

9

苯丙酮尿症

***

5

脊肌萎缩症

****

**

乳腺癌/卵巢癌易感基因

*****/*****

3.针对临床主诉怀疑有甲型血友病的受检者,检测范围需要涵盖**基因1号及**号内含子倒位的热点致病变异。(须提供既往检测报告复印件证明材料)

4.针对临床主诉怀疑有脊肌萎缩症的受检者,检测范围需要涵盖****基因7号外显子的杂合缺失/重复变异。

5.该检测涵盖线粒体基因组,可*站式覆盖对应基因上的致病位点,缩短诊疗流程和检测周期,避免序贯检测。

6.该检测可分析****/*******数据库中记录致病的至少3*个位于***区、启动子区及深度内含子区位点。

7.该方法可提示与受检者表型相关的其它变异类型,包括大片段的基因组拷贝数变异(例如缺失 /重复区间 ≥***)、染色体非整倍体、*倍体、杂合性缺失(***,区间 ≥***),及常见动态突变。

8.样本类型:外周血、羊水、脐带血、流产组织、唾液、***。

9.报告周期:收到样本**日

**.用于检测服务的基因测序仪具有****认证(属于国械注准),在临床上用于对来源于人体样本的脱氧核糖核酸(***)和核糖核酸(***)进行测序,以检测基因序列,这些基因序列可用于辅助诊断疾病或疾病易感性。单次运行最高可产出可达*****碱基的序列信息。

**.测序过程中采用线性滚环扩增技术,每次扩增均以原始的***链为模板,保持扩增的独立性。不造成错配碱基的指数累积,具有高保真度。

**.外显子捕获探针不低于***,探针设计需采用****、******、*******、*******、*******等数据库。

**.全外信息分析数据标准:

1)测序数据量不小于** G;

2)*****数据*** ≥ **%、*** ≥ **%;

3)基因组比对率 &**; **%;

4)数据重复率 &**; 8%;

▲(5)去重前深度 ≥ ****;线粒体平均深度 ≥ *****。

6)全外显子组区域覆盖度 ≥ **.5%、***覆盖度 ≥ **.5%、***覆盖度 ≥ **%;

7)捕获效率 &**; **%;

**.数据解读:

1)数据解读规则参考美国医学遗传学和基因组学学院(******** ******* ** ******* ******** *** ********,****)相关指南。

2)报告中致病位点给出明确的致病性评级证据项。

3)报告主要针对目前明确与疾病相关或可能与疾病相关的突变。



*、交付时间和地点

3.4.1、结算方法:

3.4.1.1付款人:长沙市妇幼保健院(长沙市妇幼保健计划生育服务中心)

3.4.1.2付款方式:合同签订执行后,根据每月检测订单实际完成量和中标优惠率率,按实 进行结算。

3.4.1.3实际完成量确认:以医院***系统外送标本签收入库、结果审核完成的记录为准,结算前与医院确认。

3.4.1.4付款条件:凭供应商开具的正规发票按约定的付款方式转账支付(具体付款流程按医院财务规定执行)。


*、服务标准

3.5.1中标供应商须加强检测实施的组织管理,所有参与检验的工作人员遵守有关规章制度,持证上岗。

3.5.2中标供应商负责检测项目的全部物流运输费用,包括所产生的*切冻存费、材料费、工具费、人工费、手续费、检验费等,由于搬运及运输不当造成的各种事故责任和损失由中标供应商承担。

3.5.3中标供应商应制定可靠的检测方案,采取有效安全防护措施,确保无安全事故发生。

3.5.4中标供应商负责检测资料的保管,直至采购人签收为止。


*、验收标准

1.甲、乙双方在采购和履行合同过程中所获悉的对方属于保密的内容,双方均有保密义务。

2.验收合格后,乙方出具正规发票给甲方,凭甲方开具的《合同验收报告单》办理合同价款结算手续。

3.开户行和帐号以签订的政府采购合同为准,如果乙方要求变更,则乙方必须提供加盖了财务专用章、法定代表人签字的证明文件,报经甲方审查同意。


*、其他要求

3.5.5合同签订后医院有新增加项目,中标方应同意并按已签订合同的*分比执行,否则医院有权另行委托其他第*方检测机构。

3.5.6合同期内,检测项目医院有能力自行开展的,医院可自行检测,不再委托中标人进行检测。中标*分比不予以调整。


采购需求仅供参考,相关内容以采购文件为准。

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